Software technology for conducting simulation experiments with mathematical models of physiological systems

T.V. Aksnova

Abstract


Based on the given analysis of existing systems the necessity of development of new flexible physiologist-researcher oriented system is shown. The developed system, which allows physiologists to build virtual organisms from the extendable set of blocks, is described.


Keywords


BioUML

References


Григорян Р.Д., Атоев К.Л., Лиссов П.Н., Томин А.А. Программно-моделирующий комплекс для теоретических исследований взаимодействия физиологических систем человека // Проблеми прогр. - 2006г. - №1. - с.79-92.

An integrative mathematical model of human biomedicine [Електронний ресурс] http://hummod.org/

Сайт комплексу JSim проекту Phusiome [Електронний ресурс] // http://nsr.bioeng.washington.edu.

Hunter P. The IUPS human physiome project / Hunter P., Robbins P., Noble D. // European Journal of Physiology. – 2002. – Vol.44. – p.1-9.

Bassingthwaighte J. B. Strategies for the Physiome Project / Bassingthwaighte J. B. // Annals of Biomedical Engineering. – 2000. – Vol.28. – P.1043-1058.

Simulink Release Notes / [Електронний ресурс]: http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/pdf_doc/simulink/rn.pdf.

Kolpakov F.A. BioUML – framework for visual modeling and simulation of biological systems / F.A. Kolpakov/ International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure-Systems Biology: proceedings. – Novosibirsk, 2002.

Колпаков Ф.А. BioUML – компьютерная программа для визуального моделирования биологических и других сложных систем: тезисы IV Всеросс. конф. молодых ученых по матем. моделированию и информ. технологиям (г. Красноярск, 3-5 ноября 2003) / Ф.А. Колпаков // Институт вычислительного моделирования СО РАН. – Красноярск, 2003. – С.98.

Аксенова Т.В. Імітаційне моделювання процесів клітинного реагування на дефіціт енергії. //СППМІ-2008.

Аксенова Т.В. Специализированное программное обеспечение для решения физиологических задач методом математического моделирования // Проблемы программирования. – 2008г. - №2-3. - с. 765-769.

Григорян Р.Д., Аксенова Т.В. Моделирование адаптивного реагирования организма на изменения в окружающей среде // Кибернетика и системный анализ. - 2008г. - №1. - с. 136-147.

Григорян Р.Д, Лиссов П.Н., Аксенова Т.В., Мороз А.Г. Специализированный программно - моделирующий комплекс “PHYSIOLRESP”. // Проблеми прогр. - 2009г. - №2. - с.67-82.


Refbacks

  • There are currently no refbacks.